En la evolución de la ciencia de las plantas de la universidad de Pisa ha jugado un papel importante en el campus de Pisa, nació en el siglo XVI, por Luca Ghini (1490-1556) fundador del Jardín Botánico, la costumbre de secar y preservar plantas para fines educativos y científicos, en reemplazo parcial de la antigua tradición de diseño humanista.

Hoy en día el Museo mantiene colecciones de plantas y materiales relacionados con la investigación llevada a cabo por los estudiosos durante siglos. Entre las colecciones es especialmente importante que el herbario cuenta con alrededor de 300.000 muestras. Esta es una colección de plantas que se han secado, se detiene en hojas de papel y acompañada de varias noticias sobre los lugares, fechas, y los coleccionistas de reliquias. Las hojas se clasifican de acuerdo con los criterios apropiados para el testimonio de los viajes, erborizzazioni, la investigación y descubrimientos que nos han permitido conocer la flora de las regiones de la Tierra y para descubrir nuevas entidades de la planta.